瑜伽五十二卷十五頁云:復次種子云何?非析諸行,別有實物,名為種子;亦非餘處。然即諸行、如是種姓,如是等生,如是安布,名為種子;亦名為果。當知此中、果與種子、不相雜亂。何以故?若望過去諸行;即此名果。若望未來諸行;即此名種子。如是若時望彼名為種子;非於爾時即名為果。若時望彼名果,非於爾時即名種子。是故當知種子與果、不相雜亂。譬如穀麥等物所有芽莖葉等種子、於彼物中,磨搗分析,求異種子,了不可得;亦非餘處。然諸大種,如是種姓,如是等生,如是安布,即穀麥等物,能為彼緣,令彼得生;說名種子。當知此中道理亦爾。
二解 成唯識論六卷八頁云:此中何法名為種子?謂本識中親生自果功能差別。此與本識及所生果、不一不異。體用、因果、理應爾故。雖非一異;而是實有。假法如無,非因緣故。此與諸法、既非一異;應如瓶等是假非實?若爾;真如應是假有。許則便無真勝義諦。然諸種子、唯依世俗,說為實有。不同真如。種子雖依第八識體;而是此識相分,非餘。見分恆取此為境故。
三解 俱舍論四卷十六頁云:此中何法名為種子?謂名與色、於生自果所有展轉鄰近功能。此由相續轉變差別。何名轉變?謂相續中、前後異性。何名相續?謂因果性三世諸行。何名差別?謂有無間生果功能。