以字為門，由此門而入，則可了悟諸法之理，故稱為字門。每一字均附有其一定之意義。字門有四十二字門、五字門、八字門、十九字門、二十六字門、五十字門等說。(一)四十二字門乃大品般若經卷五之四念處品、舊華嚴經卷五十七等所揭出，即：阿、羅、波、遮、那、邏、陀、婆、荼、沙、和、多、夜、吒、迦、娑、磨、迦、他、闍、[其*皮]、馱、賒、呿、叉、哆、若、[木*宅]、婆、車、摩、火、嗟、伽、他、拏、頗、歌、醝、遮、吒、荼。此四十二字門不依五十字門之順序配列，而採取獨特之配列形式，包含非字母之十餘重字（即連結字，ligature）。

(二)五字門出自四分律卷十一，即：阿（a）、羅（ra）、波（pa）、遮（ca）、那（na），此為四十二字門之最初五字。金剛頂經瑜伽文殊師利菩薩法以此為文殊菩薩之真言。四十二字門之配列形式，出典不詳，然其最初之五字出於四分律，則知其淵源久遠。

(三)八字門出自出生無量門持經等，即：波（pa）、羅（ra）、婆（ba）、迦（ka）、闍（ja）、陀（da）、賒（?a）、叉（ksa），相當於四十二字門中之第三、第六、第八、第十五、第二十、第二十二、第二十三、第二十五等字，可視為四十二字中之精萃。或謂四十二字乃以前記之五字與八字為基本而造成。

(四)十九字門乃出自海意菩薩所問淨印法門經卷十三，即：阿（a）、波（pa）、那（na）、捺（da）、沙（sa）、多（ta）、迦（ka）、娑（sa）、摩（ma）、誐（ga）、惹（ja）、馱（dha）、設（?a）、佉（kha）、叉（ksa）、倪野（jña）、他（stha）、塞迦（ska）、奼（tha），可視為四十二字門之撮略。

(五)二十六字門出自大集經卷四，即：阿（a）、遮（ca）、那（na）、邏（la）、陀（da）、波（pa）、殺（sa）、婆（?）、多（ta）、耶（ya）、婆（ba）、闍（ja）、曇（dha）、奢（sa）、佉（kha）、迦（ka）、婆（va）、摩（ma）、伽（ga）、羼（ksa）、呼（?）、若（ña）、婆（bha）、車（cha）、波（?）、頗（pha）。其配列次序不僅類似四十二字門，與此相當之西藏譯本亦舉出四十二字，由此可見其為四十二字門之略型。

(六)五十字門出自大般涅槃經卷八、文殊師利問經卷上字母品等，其依梵語字母順序配列，形式頗整齊，初為母音字，次為子音字，末尾添加一二重字。其字數通常為五十字，然或有五十一、四十六、三十八、三十四等字之不同。皆為阿阿（長音）、伊伊（長音）等順序配列，故知其與四十二字門之成立經過不同。（參閱「悉曇」4564） p2380