五念門是《往生論》的又一重要內容。

第一禮拜門，「身業禮拜阿彌陀佛如來、應、正遍知，為生彼國意故」，不僅是指禮拜阿彌陀佛這一身業，而且含有歸命阿彌陀佛的意思，歸命在身業上的表現就是禮拜。

第二讚歎門，「口業讚歎，稱彼如來名，如彼如來光明智相，如彼名義，欲如實相應故」，讚歎不僅是口業，因為如來光明智相是根本無分別智、後得無分別智即慈悲的作用，所以由此慈悲方便與如實修行相應的就是讚歎門。

第三作願門，「心常作願，一心專念，畢竟往生安樂國土，欲如實修行奢摩他故」，這一門雖然沒有如前二門所記的那樣是身業或是口業，但後面的解義分明確說是意業，一心專念作願往生淨土，修奢摩他行。奢摩他，就是心一境相，心專注於某一對像，心進入寂靜的狀態，所以奢摩他又稱為心的寂靜相。在這種狀態觀察世俗的世界，就是觀察門的毗婆舍那。

第四觀察門，「智慧觀察，正念觀彼，欲如實修行毗婆舍那故。彼觀察有三種。何等三種。一者觀察彼佛功德國土莊嚴，二者觀察阿彌陀功德莊嚴，三者觀察彼佛菩薩功德莊嚴」，觀察門的內容佔據了《淨土論》的大半，解義分中稱為智業。

五念門的主幹是作願、觀察二門，中心是奢摩他、毗婆舍那。奢摩他和毗婆舍那的行業是大乘佛教的重要的行業，漢譯分別作止和觀，是瑜伽唯識論書中的重要用語。因此作願和觀察二門是瑜伽行的淨土教式的論述。

第五迴向門，「不捨一切苦惱眾生，心常作願迴向為首成就大悲心故」，迴向一切眾生，往生淨土。

五念門以止觀為中心，前後配以禮拜、讚歎、迴向。這種行業體系與《大乘莊嚴經論》、《中邊分別論》、《攝大乘論》等瑜伽唯識系統的論書中所示的實踐體系有關。例如，讚歎、作願、觀察三門中有「如實修行」一語，在《究竟一乘寶性論》中和「遍修行」併用，作「如實修行遍修行」，是唯識論書中與根本無分別智、無分別後得智相對應的重要用語。